Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SNX17Q15036 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.5 ms