Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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