Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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KRTAP13-3Q3SY46 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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KRTAP13-3Q3SY46 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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KRTAP13-3Q3SY46 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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KRTAP13-3Q3SY46 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRTAP13-3Q3SY46 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP13-3Q3SY46 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP13-3Q3SY46 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP13-3Q3SY46 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP13-3Q3SY46 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRTAP13-3Q3SY46 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
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