Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pacs2Q3V3Q7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs2Q3V3Q7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms