Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sdr16c6Q05A13 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms