Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933424G06RikA0A140LIP3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 453.1 ms