Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DDB1Q16531 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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