Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNTA1Q13424 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNTA1Q13424 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185 ms