Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhoP15409 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhoP15409 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhoP15409 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhoP15409 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms