Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb3P09026 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms