Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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