Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNN3Q15417 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CNN3Q15417 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CNN3Q15417 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CNN3Q15417 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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