Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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GRIK3Q13003 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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GRIK3Q13003 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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GRIK3Q13003 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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GRIK3Q13003 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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GRIK3Q13003 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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GRIK3Q13003 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK3Q13003 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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