Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng3Q9JJV5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms