Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atad1Q9D5T0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atad1Q9D5T0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms