Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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