Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knl1Q66JQ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knl1Q66JQ7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms