Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms