Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn6Q03958 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms