Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a3A2ACT7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Col9a3A2ACT7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms