Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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FOXD4Q12950 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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FOXD4Q12950 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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FOXD4Q12950 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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FOXD4Q12950 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
FOXD4Q12950 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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