Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SardhQ99LB7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms