Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms