Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdr16c6Q05A13 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdr16c6Q05A13 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms