Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga1P29974 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms