Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif3aP28741 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms