Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhoP15409 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhoP15409 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhoP15409 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhoP15409 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RhoP15409 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhoP15409 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhoP15409 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhoP15409 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms