Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPN13Q12923 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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