Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KLF9Q13886 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
KLF9Q13886 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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