Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms