Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psme1P97371 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms