Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga1P29974 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga1P29974 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms