Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RhoP15409 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RhoP15409 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.7 ms