Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms