Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt71Q9R0H5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms