Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Knl1Q66JQ7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Knl1Q66JQ7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms