Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms