Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psme1P97371 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psme1P97371 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms