Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NclP09405 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NclP09405 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NclP09405 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NclP09405 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NclP09405 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NclP09405 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NclP09405 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NclP09405 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NclP09405 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NclP09405 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NclP09405 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NclP09405 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms