Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01666 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01666 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01666 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01666 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01666 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01666 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01666 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01666 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01666 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01666 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01666 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01666 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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