Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna3O08545 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna3O08545 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms