Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt27Q9Z320 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt27Q9Z320 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt27Q9Z320 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt27Q9Z320 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt27Q9Z320 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt27Q9Z320 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms