Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C8

Ybx2, Y-box-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx2Q9Z2C8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ybx2Q9Z2C8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx2Q9Z2C8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ybx2Q9Z2C8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ybx2Q9Z2C8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ybx2Q9Z2C8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms