Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdc45Q9Z1X9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc45Q9Z1X9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc45Q9Z1X9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdc45Q9Z1X9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdc45Q9Z1X9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdc45Q9Z1X9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms