Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NfkbiaQ9Z1E3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NfkbiaQ9Z1E3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfkbiaQ9Z1E3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms