Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4fQ9Z123 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4fQ9Z123 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4fQ9Z123 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4fQ9Z123 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4fQ9Z123 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms