Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Nup160Q9Z0W3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Nup160Q9Z0W3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Nup160Q9Z0W3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Nup160Q9Z0W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Nup160Q9Z0W3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Nup160Q9Z0W3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Nup160Q9Z0W3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Nup160Q9Z0W3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Nup160Q9Z0W3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Nup160Q9Z0W3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Nup160Q9Z0W3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Nup160Q9Z0W3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Nup160Q9Z0W3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms