Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stub1Q9WUD1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stub1Q9WUD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stub1Q9WUD1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stub1Q9WUD1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stub1Q9WUD1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms