Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TfebQ9R210 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TfebQ9R210 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TfebQ9R210 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TfebQ9R210 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TfebQ9R210 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TfebQ9R210 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TfebQ9R210 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfebQ9R210 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TfebQ9R210 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfebQ9R210 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms