Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Znf346Q9R0B7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Znf346Q9R0B7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf346Q9R0B7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf346Q9R0B7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf346Q9R0B7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms